Ege Üniversitesinden kansere yönelik önemli bir proje daha…

Egeli bilim insanlarının projeleri TÜBİTAK tarafından desteklenmeye devam ediyor. Yürütücülüğünü Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Kolu öğretim üyesi Prof. Dr. Çığır Biray Avcı’nın üstlendiği, “LncRNA Linc01551’in Gaye Gen Profilinin İncelenmesi ve Gbm Progresyonundaki Rolünün Epitelyal-Mezenkimal Geçiş Yolu Üzerinden Araştırılması” başlıklı proje, TÜBİTAK -ARDEB “1001-Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı” kapsamında desteklenmeye uygun bulundu.

Proje kapsamında Egeli bilim takımı, bir çeşit beyin kanseri olarak bilinen Glioblastoma (GBM) üzerine kıymetli çalışmalar yürütecek. EÜ Histoloji ve Embriyoloji Anabilim Dalı’ndan Prof. Dr. Hüseyin Altuğ, Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı’ndan Doç. Dr. Bakiye Göker’in yer aldığı projenin araştırma ayağında ise EÜ Onkoloji ve Tıbbi Biyoloji doktora öğrencileri Elham Shahriyari ile Asghar Khalilnezhad yer alıyor. Projenin yurt dışı danışmanlığını ise Harvard Üniversitesi Brigham and Women’s Hospital’dan Dr. Ahad Khalilnezhad Zeinabad üstleniyor.

Ege Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Necdet Budak, proje yürütücüsü Prof. Dr. Çığır Biray Avcı’yı makamında ağırlayarak çalışmaları hakkında bilgi aldı. Bir kültür haline getirdikleri bilim üretme ekosisteminin somut çıktılara dönüşmesinden büyük memnunluk duyduklarını tabir eden Rektör Prof. Dr. Budak, proje takımına çalışmalarında muvaffakiyetler diledi.

“RNA’lar kanserin oluşumu ve tedavi direncinde kıymetli rol oynuyor”

Proje hakkında bilgi veren Prof. Dr. Çığır Biray Acı, “Projemiz, uzun kodlamayan RNA moleküllerinden biri olan LINC01551’in rolünü ve bu molekülün kanserin ilerlemesinde nasıl tesirli olduğunu incelemeyi amaçlıyor.  Glioblastoma (GBM), moleküler yapıdaki karmaşıklığı nedeniyle tedavisi güç bir kanser tipi olarak bilinmektedir. Son yıllarda kullanılmaya başlanan Tek Hücre RNA Sekanslama (scRNA-seq) teknolojisi, kanser üzere hastalıkların araştırılmasında büyük bir ilerleme sağlamıştır. Bu teknoloji, genlerin ve uzun kodlamayan RNA’ların hücre seviyesindeki tabir profilini tahlil ederek kanserin içsel farklılıklarını ortaya çıkarmaya imkan tanır. Yapılan son araştırmalar, protein kodlayan genlerin yanı sıra uzun kodlamayan RNA’ların da kanserin oluşumu, ilerlemesi ve tedavi direncinde değerli rol oynayabileceğini göstermektedir. Bu çalışma kapsamında, 14 GBM hastasına ilişkin tek hücre RNA sekanslama bilgileri kullanılarak 12.133 farklı uzun kodlamayan RNA molekülünün tabir seviyeleri incelenmiştir. Yapılan tahliller sonucunda, LINC01551 isimli uzun kodlamayan RNA molekülünün GBM hastalarında değerli bir rol oynadığı ve bu molekülün kanserin kötüleşmesinde epitelyal-mezenkimal geçiş yoluyla tesirli olduğu belirlenmiştir. Ayrıyeten yapılan korelasyon tahlilleri, LINC01551’in beyin dokusunda en az 154 genin tabir seviyesini etkileyebileceğini göstermiştir” dedi.

Prof. Dr. Biray Avcı, “Bu çalışmanın deneysel kademesinde, LINC01551’in tesirlerini daha güzel anlamak için CRISPR-Cas9 üzere yeni teknikler kullanılacak ve bu molekülün etkilediği gen profili hem laboratuvar ortamında hem de fare modelleri üzerinde incelenecektir. Elde edilen bulgular, Sanger dizileme, RT-qPCR ve Western Blot üzere sistemlerle doğrulanacaktır. Bu bulguların, LINC01551’in fizyolojik ve patofizyolojik rollerini anlamamıza yardımcı olması ve GBM’nin gelişimindeki tesirlerini anlamak açısından kıymetli olduğu düşünülmektedir” diye konuştu.

Kaynak: (BYZHA) Beyaz Haber Ajansı